与每年的季节性呼吸道疾病防疫活动一样，法国2025年的疫苗施打工作的主要目标仍然是高风险人群，也就是年龄在65岁以上者、孕妇、有慢性疾病者、肥胖症者以及养老院人群。与往年不同之处在于，绝大部分医护人员或高风险人群的家庭服务人员、或导游等行业的工作者也在疫苗施打范围之内。这个人数大约1900万的目标人群均可免费要求注射流感疫苗。而新冠疫苗则继续对所有人都免费。
卫生部门强烈建议民众同时施打流感疫苗和新冠疫苗。今年的流感疫苗共有五种，都是在同一病毒株基础上研究而成。但卫生部门尤其建议年长者选择赛诺菲（Sanofi）药厂开发的Efluelda以及由Seqirus生物科技公司开发的Fluad，认为这两款疫苗对这一年龄段人群更为有效。而新冠疫苗则是辉瑞公司的Comirnaty。
但疫苗接种季节到来，也面对着社会上挥之不散的疫苗怀疑论。人们在新冠疫情大流行期间的恐惧心理逐渐散去，接种疫苗的热情也在逐年降低。在法国，去年只有一半的目标人群接种了流感疫苗，新冠疫苗接种率则更低。结果是，法国去年秋冬的流感疫情格外严重。法国公共卫生署认为，去年至少有一万七千人因感染季节性流感而死亡，远高出年平均为一万人的水平。
法国国家健康与医学研究院（INSERM）官方网站近日特别发表文章，列出疫苗怀疑论所依赖的七大错误解读。首先是认为，只要不要求必须施打，就意味着疫苗并非真正有用。但文章指出，虽然有些疫苗只是建议施打，但他们对预防疾病的效用确实经过严谨的试验，并有事实依据。而且季节性流感虽然是秋冬季节的多发病，但却可能带来非常严重的后果。根据世界卫生组织的统计，全球每年都有29万到65万人死于这个看似平常的季节性感染。
还有人认为，抗击病毒最有效的方法不是疫苗，而是真正感染病毒，由此激发身体自身免疫功能的反应。但法国国家健康与医学研究院官网的这篇文章指出，这种认知由来已久，但十分危险。历史上，鼠疫、天花、西班牙流感、艾滋病、还有最近的新冠-19，都导致全球数以百万计的人死亡，足以证明人体免疫功能不足以自行抵抗所有的严重疾病。疫苗则可以激发人体免疫功能，做出足够有效的抗病毒反应。
关于新冠疫苗，有人说目前流行的信使核糖核酸疫苗会改变人体自身基因，或者引发一些可能祸及后代的后果。法国国家健康与医学研究院官网文章指出，这绝不可能。因为信使疫苗并不会进入包含基因元素的细胞核。疫苗的功能只在于生产抗疫蛋白，他会在几小时或几天后消解。而且，为满足对蛋白的需要，人体细胞其实每时每刻都在生成数以千计的信使ARNm。
总而言之，科学界的众多数据显示，疫苗的防疫效用远远超出感染病毒带来的风险。当然，面对流感和新冠病毒的传染病，在施打疫苗之外，佩戴口罩、勤洗手等习惯仍然是非常有效的防病作为。